北海道大学综合博物馆（The Hokkaido University Museum）1884年成立，隶属于北海道大学。该馆目前共收藏有超过400万件标本与资料，展现了北海道大学的学术传统以及最新的科研成果。
历史：
北海道大学综合博物馆的历史可追溯至19世纪后期的札幌农学校时代，学校初任校长 William Smith Clark 在建校第二年就曾提出希望建立一所自然史博物馆。1884年，北海道开拓使将植物园及植物园内博物馆让渡给札幌农学校，学校附属博物馆就此成立。
二战结束后，札幌农学校更名为北海道大学。1966年该校将成立一所综合博物馆的想法提上议程，1999年获得日本文部省的批准，北海道大学综合博物馆正式成立。
为纪念北海道大学创立125周年，博物馆于2001年进行首次翻修。2007年，大学内水产学部的水产科学馆成为博物馆分馆。
北海道大学综合博物馆建筑外观
展厅及馆藏：
北海道大学综合博物馆分为主馆、札幌农业学校第2农场和水产科学馆三部分。
主馆位于北海道大学札幌校区，前身是1929年建成的旧理学部主馆建筑风格为现代哥特式，是校内最早的钢筋水泥制建筑。馆内藏品以标本及考古资料为主，分为六个部分。
「医学标本」部分展有解剖学所用的蜡制皮肤印模，「考古遗物」里包括人工制品、骨头、植物种子、碳化物等各类出土遗物。「生物标本」部分有植物、海藻、昆虫、鱼类、菌类等，其中含有亚洲地区珍贵的正型标本（Holotype），即用来判断新种类的基准标本。
生物标本
「古生物标本」展有古代生物化石，「矿物岩石标本」内有各种展现北海道地质景观的矿物岩石标本，「科学技术史资料」展有在北海道大学科学研究中起到重要作用的仪器及设备。
矿物岩石标本
札幌农业学校第2农场亦位于北海道大学札幌校区，1876年建立，是日本第一个西洋式农业建筑，收藏有明治初期从欧美进口的农具、日本早期拖拉机、全国各地的农业机械等，介绍了日本农业机械化的发展和北海道的开发过程。
水产科学馆坐落于函馆校区，是北海道大学水产学部的设施之一，于1958年正式开馆，2007年成为综合博物馆的分馆。该馆分类整理和收藏水产方面的学术资料，尤其是日本北部地区的水产标本、模型和文献。
数字：
北海道大学综合博物馆隶属北海道大学，收藏1876年建校以来收集的超过400万件研究标本与资料，其中正型标本超过1.3万件。
近年重要展览：
北海道地质景观的化石
展期：2017-4-28 ~ 2017-6-18
北海道大学古生物学的巨人们
展期：2017–1-31 ~ 2017-4-2
部分展品
岩沙海葵毒素（Palytoxin）化学结构模型
这种毒素于1971年首次从夏威夷海藻类珊瑚「Palythoa toxica」中分离，因此以英文单词前缀「Paly-」与「toxin-」命名。1994年哈佛大学岸佳史教授首次实现「全合成」，确定了该毒素的化学结构。
考古遗物
部分展厅
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